وظایف و اختیارات مرجع ملی بـه شرح زیر می باشد:

الف ـ تدوین طرح ها و برنامه های ارتقای حقوق کودک و ترویج احترام بـه شخصیت وی

ب ـ پایش و ارزیابی رعایت حقوق کودک در سطح ملی

پ ـ ارایه نظرات مشورتی در زمینه قوانین، مقررات، رویه ها و برنامه های مرتبط با حقوق کودک بـه دستگاه های اجرایی و موسسات و تشکیلات غیر دولتی

ت ـ پیشنهاد اصلاح قوانین و مقررات موجود و تهیه پیش نویس لوایح قانونی برای ارایه بـه شورای هماهنگی

ث ـ تهیه گزارش ملی حقوق کودک با همکاری و مشارکت سایر نهادها و دستگاه های ذی ربط و ارسال آن بـه مراجع ذی صلاح داخلی و از طریق وزارت امور خارجه بـه مراجع ذی صلاح بین المللی، پس از تصویب شورای هماهنگی

ج ـ تهیه گزارش در خصوص موارد نقض حقوق کودک در جامعه و ارسال آن بـه مراجع ذی ربط داخلی با رعایت قوانین و مقررات مربوط پس از تصویب شورای هماهنگی

چ ـ انجام مطالعات مربوط بـه حقوق کودک از طریق همکاری با سایر موسسات و مراکز علمی

ح ـ تهیه گزارش های سالانه و موردی و ارایه آن بـه روسای قوای سه گانه و دفتر مقام معظم رهبری پس از تصویب شورای هماهنگی

خ ـ اطلاع رسانی مستمر و همه جانبه و ارتقای سطح آگاهی در خصوص موضوعات مرتبط با حقوق کودک با همکاری وزارت آموزش و پرورش، سازمان صدا و سیمای جمهوری اسلامی ایران و سایر رسانه های گروهی

د ـ هماهنگی و تبادل اطلاعات علمی و تحقیقی با مراجع داخلی و بین المللی در موضوعات حقوق کودک

ذ ـ همکاری با سازمان ها و نهادهای بین المللی بـه منظور ترویج و اجرای حقوق کودک با همکاری و هماهنگی دستگاه های ذی ربط از طریق وزارت امور خارجه