هیات عالی نظارت دارای دبیر خانهای میباشد کـه زیر نظر رییس هیات اداره خواهد شد. دبیر و کارکنان دبیرخانه از بین کارمندان سازمان توسط رییس هیات عالی نظارت و با هماهنگی قبلی مدیر عامل تعیین میشود. دبیرخانه برای انجام وظائف خود از امکانات اداری و مالی سازمان استفاده خواهد نمود.