وظایف شورا:

1 ـ تصویب برنامه کار سالانه سازمان حفظ نباتات کشور.

2 ـ تصویب فهرست آفات و بیماری های عمومی نباتات و قرنطینه ای داخلی.

3 ـ تصویب بودجه تفصیلی و اصلاح بودجه سازمان به میزان اعتبار مصوب.

4 ـ بررسی گزارش های سازمان حفظ نباتات یا اطلاعاتی که از منابع مختلف به دست می آید و اظهار نظر و صدور دستورهای لازم.

5 ـ انجام وظایفی که طبق مواد 9 و 10 و 13 و 21 این قانون به عهده شورا محول گردیده است.