ارکان تابعه سازمان به شرح زیر می باشد:

الف - مجمع عمومی نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران کـه در این قانون " مجمع " نامیده می شود.

ب - شورای عالی نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران کـه در این قانون " شورای عالی " خوانده می شود و دبیرخانه آن در سازمان نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران کـه در تهران است مستقر می باشد.

ج - رییس کل.

د - هیات مدیره نظام پزشکی شهرستان ها و شورای هماهنگی استانی.

تبصره - وظایف و اختیارات و ساختار تشکیلاتی شورای هماهنگی استانی به پیشنهاد رییس کل به تصویب شورای عالی خواهد رسید.

هـ - هیات های انتظامی رسیدگی به تخلفات صنفی و حرفه ای شاغلین گروه پزشکی و حرف وابسته.

و - بازرسان.

ز - صندوق رفاه و تعاون.