معاونت موظف است با همکاری دستگاه های اجرایی ذی ربط، نسبت بـه تحقق اهداف زیر در منطقه اقدام نماید:

1 ـ ایجاد زیست بوم نمونه و جامع فناوری و نوآوری شامل محیط کار و زندگی مطلوب.

2 ـ ایجاد زنجیره و نظام کامل سرمایه گذاری و تأمین مالی فناوری و نوآوری.

3 ـ ایجاد پایگاه برتر جذب و فعالیت متخصصین ایرانی غیر مقیم کشور.

4 ـ استقرار سرمایه گذاران خارجی حوزه فناوری در منطقه جنوب غرب آسیا بـه عنوان یکی از (10) پایگاه برتر.

5 ـ فعالیت حداقل (2500) واحد و هسته فناور تا سال 1408.

6 ـ استقرار حداقل (10) مرکز دانشگاهی، آزمایشگاه و مرکز ملی توسعه فناوری و نوآوری.

7 ـ استقرار حداقل (50) شرکت و سازمان غیر ایرانی مرتبط با حوزه فناوری.

8 ـ فعالیت حداقل (50) هزار نفر در واحدهای فناور.

9 ـ کسب سهم (30) درصدی منطقه از فروش شرکت های دانش بنیان کشور.

10 ـ صادرات محصولات و خدمات واحدهای فناور مستقر در منطقه بـه حداقل (60) کشور جهان.